Το 1986, με πρωτοβουλία της Λέσχης, ιδρύθηκε το Ίδρυμα Ιστορίας του Ελευθερίου Βενιζέλου. Οι στόχοι και οι σκοποί του, σύμφωνα με τον Οργανισμό του (ΦΕΚ Β΄352/ 26.5.1986) είναι:

• Συγκέντρωση ιστορικών αρχείων για την ιστορία του Ελευθερίου Βενιζέλου καθώς και της αντίστοιχης περιόδου του εθνικού και ιστορικού βίου των Ελλήνων. Τα χρονικά όρια, πάντως, του ιστορικού πλαισίου του Ιδρύματος είναι δυνατόν να επεκταθούν, κατά την κρίση της Διοίκησης, και σε ιστορικές περιόδους που προηγούνται εκείνης του Ελευθερίου Βενιζέλου ή και την ακολουθούν, έτσι ώστε να διασφαλίζεται μια ολιστική θεώρηση των ιστορικών γεγονότων.
• Η συστηματική ταξινόμηση και οργάνωση αυτού του υλικού, ώστε να είναι αξιοποιήσιμο από ερευνητές,
• Η διευκόλυνση και, γενικώς, η προώθηση συγγραφής μονογραφιών για τα θέματα που σχετίζονται με το Ίδρυμα.

Πρώτος Πρόεδρος του Ιδρύματος Ελευθερίου Βενιζέλου υπήρξε ο Μιχαήλ Στασινόπουλος (Ακαδημαϊκός και πρώτος προσωρινός Πρόεδρος της Ελληνικής Δημοκρατίας), ενώ ακολούθησαν o Ελευθέριος Κ. Βενιζέλος (τελευταίος εγγονός του Εθνάρχη), ο Γεώργιος Κ. Στεφανάκης και ο Νέστωρ Ε. Κουράκης.

Σήμερα, το Ίδρυμα συνεργάζεται στενά με τη Λέσχη, αξιοποιώντας τον πλούτο των συλλογών της και το αρχειακό της υλικό. Διοργανώνονται έτσι κοινές επιστημονικές εκδηλώσεις, δημοσιεύονται μελέτες ως απότοκο αυτών των εκδηλώσεων, διατηρείται κοινή ιστοσελίδα, τα Διοικητικά Συμβούλια των δύο φορέων συνεδριάζουν από κοινού και ο σχεδιασμός των δράσεων γίνεται κατά τρόπο ώστε, με τη συμβολή των δύο φορέων, να προάγεται η μνήμη για το έργο που επιτελέσθηκε κατά τις πρώτες δεκαετίες του 20ού αιώνα από τον Ελευθέριο Βενιζέλο ως αναμορφωτή της νεότερης Ελλάδας και πρωταγωνιστή της εδαφικής της ολοκλήρωσης.